Compare os relatórios abaixo:

SPED REGISTROS FISCAIS - CONSOLIDAÇÕES DAS OPERAÇÕES POR CST:

                                             imagem 1.

LIVRO DE ENTRADA:

OBS: O relatório de Livro de Entradas que esta sendo comparando com o SPED. A divergência ocorre, devido o ICMS Desonerado pois, o SPED de PIS/COFINS não abate o valor do item. Com isso, foi colocado para abater o valor caso o parâmetro  'Sped Contribuições - Abater o valor do desconto no campo VL_ITem do registro C170 - Compra' estiver ativo. TICKET N° 94338.

Portanto, quando o parâmetro estiver ativo o relatório do Sped de Contribuição estará da seguinte maneira, batendo com o Livro de Entradas, como na imagem 1:

A rotina, funcionará a partir da versão - Atualização Gestores 1.0.2.200.